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牛津新一代USB DNA测序仪轰动市场

导读: 在上周召开的基因组生物学技术进展年会(AGBT)上,英国Oxford Nanopore Technologies公司宣布推出一款便携式的基因组测序仪,约摸只有U盘大小,价格低于900美元,立即引起市场轰动。

  在上周召开的基因组生物学技术进展年会(AGBT)上,英国Oxford Nanopore Technologies公司(简称Oxford)宣布推出一款便携式的基因组测序仪,约摸只有U盘大小,立即引起市场轰动。

  Oxford在去年揭开了其纳米孔测序平台GridION的神秘面纱。该系统将使用带有多个蛋白纳米孔的阵列芯片来分析DNA、RNA和蛋白等。该阵列芯片放置在一次性的cartridge内,cartridge随后上样到节点(node)内。用户可根据需要,连接若干个这样的节点,组成一个可扩展的测序平台。

  就在大家对这款仪器翘首盼望时,Oxford又宣布了一个爆炸性的消息,便携式的测序系统MinION即将在下半年上市。这款仪器只有U盘大小,价格低于900美元。这两款系统都有望带来高达100 kb的读长,而原始错误率大约在1%左右。

  消息一发布,立即引发市场轰动,有人甚至认为这是愚人节的玩笑。上个月,Life Technologies和Illumina各自发布了一款新产品,旨在一天内完成人类基因组测序。据Oxford介绍,GridION有望带来15分钟的人类基因组测序,而MinION则更是一个大转折(game-changer)。

MinION 便携式的测序仪

  Oxford的CEO Gordon Sanghera认为,即插即用的MinION将带来DNA测序的更广泛应用,“这将允许非专业科学家提取DNA信息。您需要的只是一台笔记本电脑和软件。”不过,MinION设备是一次性的,产量也不如GridION那么高。

  除了大小,让人惊异的还有读长。目前新一代测序技术的读长普遍在200-300 bp,罗氏454的平台去年升级为1000 bp,第三代PacBio RS系统的读长达到3000 bp,当时已视为重大飞跃。如今,Oxford的测序平台将带来100 kb的读长,有望解决很多目前无能为力的问题。

  然而,以上皆为Oxford公布的数据,目前尚未发表文章,也还没有客户试用过。因此,可能要等到早期试用客户使用过,或有论文发布,才能真正确定该平台的性能是否如此出色。

  强大竞争对手的出现,让本来就不平静的测序市场再次掀起波澜。各大测序公司的股价应声齐跌。Life Technologies跌6%,Illumina跌3%,PacBio跌5%,Complete Genomics跌3%。

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