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美国开发出全球第一台蛋白质组学高通量质谱仪

2011-10-19 14:47
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  来自美国能源部(DOE)西北太平洋国家实验室(Pacific NorthwestNationalLaboratory,PNNL)的研究人员发明了一种新型仪器能提高蛋白表达检测的速度和质量。这种蛋白质谱仪(protein massspectrometer,PROMS)是开发的第一个针对蛋白质组学研究的高通量质谱仪。这一质谱仪由Richard D.Smith和他的同事从一种9.4特斯拉的傅立叶变换离子回旋共振质谱仪(Fourier Transform Ion CyclotronResonance Mass Spectrometer)改装而来——这种共振质谱仪是由BrukerDaltonics(布鲁克·道尔顿公司,著名的仪器公司)制造。

  根据PNNL的报告,PROMS相比于其它MS,灵敏性高100多倍,速度也要快10-100倍。这项新的设计集合了Smith和他的团队的一项发明:在MS上应用动力学范围增长(dynamicrange enhancement applied to massspectrometry,DREAMS)。这样克服了MS同一时间能测量的分子数量限制障碍,利用DREAMS研究人员能排除最大,丰度最高的蛋白的影响,将精力集中在低水平蛋白上。Smith表示,在生物过程中越是数量少,不常见的“player”越是起着重要的作用,就像细胞信号传导过程中信号因子的作用。

  PNNL研究人员利用这一系统检测了一巨细胞病毒(cytomegalovirus)——已知引起视网膜炎症,以及DOE感兴趣的3个微生物。在2002年利用PROMS,研究人员识别了耐辐射奇球菌(DeinococcusRadiodurans)中预测蛋白质组的1900多个蛋白(大约共3,200个,占61%)(M.S. Lipton et al.,“Global analysis of the Deinococcus radiodurans proteome by usingaccurate mass tags,” Proceedings of the National Academy ofSciences, 99:11049-54, Aug. 20, 2002.),这项成果是当时为止任何生物中覆盖最广的蛋白质组分析结果。

  Bruker公司副总裁,生命科学系统总经理JohnWronka认为PROMS技术是哺乳动物蛋白质组学以及“代谢体学”(metabolomics)——一个全新的代谢研究而准备的一门技术,目前PerkinElmer,Bruker等公司都有PROMS仪器,其中PEI的蛋白组学质谱样品预制工作站特点包括:

  全自动密封系统,杜绝手工操作和环境引入的外来污染,保证样品回收率和重现性。

  全自动完成样品脱盐、浓缩和汛积至MALDl tarqet过程。

  精密的液体处理系统可精确控制样品的吸附和解吸动力学过程,提高样品回收率和重现性,并保证质谱检测的灵敏度。

  一次处理96个样品。

  灵敏度: 200fmoI BSA。

  可使用Millipore Zip Tip或Amika ProTip。

  兼容所有常用MALDl targets。

声明: 本文由入驻维科号的作者撰写,观点仅代表作者本人,不代表OFweek立场。如有侵权或其他问题,请联系举报。

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