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TECAN自动化工作站:下一代测序中样本制备的“神兵利器”

导读: 下一代测序彻底改变了基因组学研究领域,使全基因组测序比以往任何时候都更有效率。然而,典型的NGS工作流程是鲜有革新的,因为它面临着许多手动操作步骤及来自成本、通量以及结果变异性的诸多挑战。

  下一代测序(Next Generation Sequencing, NGS)彻底改变了基因组学研究领域,使全基因组测序比以往任何时候都更有效率。然而,典型的NGS工作流程是鲜有革新的,因为它面临着许多手动操作步骤及来自成本、通量以及结果变异性的诸多挑战。传统的手动样品制备方法不仅非常耗时,而且更易出错。面对这些挑战,TECAN自动化工作站提供了相应的解决方案,不仅提高了工作效率,而且保证了测序结果的准确可靠,堪称下一代测序中样本制备的“神兵利器”。

  2011年,日本横滨RIKEN Omics科学中心(RIKEN Omics Science Center)的研究人员开发出一种新的基因表达分析技术,只需100 ng总RNA,就能准确定量的测定基因表达水平,这项技术被称为“HeliScopeCAGE”,它将RIKEN的CAGE*(Cap Analysis of Gene Expression, CAGE)与Helicos BioSciences的单分子测序仪HeliScope相结合,为稀有细胞群体的基因表达分析开启了大门。

  HeliScopeCAGE的成功开发并没有让RIKEN的研究人员们高兴太久,因为长达3周(制备测序仪运行一次所需的48个样本)的复杂手工操作随时可能因为一个小小的失误而从头开始。幸运的是,在TECAN公司帮助下,他们成功构建了Freedom EVO 150-8全自动样本处理平台(如下图),将样本制备时间成功缩短到8天/192标本,并可同时满足两台HeliScope的平行工作。通过流程的优化与改进,cDNA的产量和质量以及文库的质量都与手工操作相一致,并且测序结果也具有较高的重复性。

  30年的创新和发展开创了基因组测序的新时代,测序技术从手工的一次一个样本发展到基于高通量测序仪的高度自动化技术,测序仪通量的提高对样本制备提出了更高的要求,TECAN作为全球领先的自动化平台及解决方案的制造商已经做好准备——Automation. That is what TECAN is for。

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